Agrobacterium sp. C289 (AC1)

La cepa tiene el complejo molecular nif HDK permitiendo la producción de nitrogenasa, la cual permite la reducción del nitrógeno molecular atmosférico a amoníaco. Los recuadros redondeados indican la ubicación de los genes primordiales para el proceso; el color gris indica la presencia de los genes en el genoma de la bacteria.

Una de las vías de solubilización de fósforo es por medio de la producción de ácido glucónico o gluconato, en la cual, la cepa AC1 tiene el potencial para producir este compuesto de dos diferentes formas, mediante la vía dependiente de la glucosa 1-deshidrogenasa apoyada por la coenzima pirroloquinolina quinona (pqq) o mediante la vía de la quinoproteína glucosa deshidrogenasa. Los recuadros redondeados indican la ubicación de los genes primordiales para el proceso; el color gris indica la presencia de los genes en el genoma de la bacteria.

La cepa AC1 tiene el potencial para producir compuestos indólicos a partir de L-triptófano usando dos vías. En la primera, L-triptófano mediante la enzima L-aminoácido oxidasa se produce indol piruvato, el cual por la acción de la enzima Indolpiruvato descarboxilasa se produce Indol-3-acetaldehído. En la segunda, L-triptófano por medio de Triptófano 2-monooxigenasa permite la síntesis de Indole-3-acetamida que posteriormente se convierte en Indol-3-acetato por la acción de la Amidasa. Los recuadros redondeados indican la ubicación de los genes primordiales para el proceso; el color gris indica la presencia de los genes en el genoma de la bacteria.

A pesar de no presentar actividad en laboratorio, la cepa AC1 tiene el potencial para la producción de la enzima ACC-desaminasa. El gen acdS codifica la enzima ACC-desaminasa, la cual permite a la bacteria modular los niveles nocivos de etileno en la planta bajo condiciones de estrés. El gen acdR regula la transcripción del gen acdS mediante una proteína reguladora de respuesta a leucina (LRP) que en ausencia de ACC bloquea la transcripción de acdS uniéndose a la caja-LRP. En presencia de ACC, la proteína LRP forma un complejo con la proteína AcdB y dependiendo si las condiciones son aerobias (CRP) o anaerobias (FNR), se inicia la transcripción del gen acdS y la producción de la enzima ACC-desaminasa. Los recuadros redondeados indican la ubicación de los genes primordiales para el proceso; el color gris indica la presencia de los genes en el genoma de la bacteria.